位置>千里馬招標(biāo)網(wǎng)> 招標(biāo)中心> 深圳大學(xué) - 競價(jià)結(jié)果公告(CF105902024000164)
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長鏈非編碼 RNA 測(cè)序服務(wù) | 技術(shù)服務(wù) | 122500.00 | 按行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)提供服務(wù);知識(shí)產(chǎn)權(quán):雙方確定,本項(xiàng)目不論是單方獨(dú)立完成或雙方**完成的與**項(xiàng)目有關(guān)的階段性、最終科研成果及相關(guān)知識(shí)產(chǎn)權(quán)權(quán)利歸甲方所有。 | 1.完成50例微量RNA樣本長鏈非編碼 RNA 信息采集,構(gòu)建DNBSEQ文庫并上機(jī)測(cè)序,每個(gè)樣本的目標(biāo)采集數(shù)據(jù)量為10G的 clean data,并完成相應(yīng)的生物信息分析; 2、****實(shí)驗(yàn)室擁有自主DNBSEQ測(cè)序平臺(tái)30臺(tái)以上。 3、基本分析 3.1 lncRNA、mRNA、circRNA 信息分析(circRNA 僅限人、小鼠); 1、基本數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì); ① 去除接頭序列、低質(zhì)量序列得到 reads 信息; ② 樣品相關(guān)性; ③ 表達(dá)量分布; ④ RNA 分類; 3.2、參考基因組比對(duì); 3.3、lncRNA、mRNA、circRNA 鑒定; 3.4、lncRNA、mRNA、circRNA 定量分析; 3.5、lncRNA、mRNA、circRNA 差異表達(dá)分析(樣本間、組間); 3.6、lncRNA、mRNA、circRNA 表達(dá)/差異基因聚類; 3.7、mRNA 差異基因 GO 分類、富集; 3.8、mRNA 差異基因 KEGG 分類、富集; 3.9、mRNA 結(jié)構(gòu)分析; ① 可變剪切分析; ② 融合基因分析(僅限人); 3.10、Dr.Tom 多組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)信息分析; 一)數(shù)據(jù)庫注釋; 1、轉(zhuǎn)錄因子注釋(基于基因 ID,在 AnimalTFDB/PlantTFDB 獲得注釋) 2、GSEA分析; 3、基于 Uniprot 數(shù)據(jù)庫,獲得 Pfam、Reactome、COG、EggNOG 和InterPro數(shù)據(jù)庫注釋信息; 二)互作網(wǎng)絡(luò)分析; 1、靶基因分析; ① miRNA-mRNA 靶向關(guān)系分析; ② lncRNA-mRNA 靶向關(guān)系分析; 2、ceRNA 互作網(wǎng)絡(luò)分析(lncRNA、mRNA); 3、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析; 4、共表達(dá)互作網(wǎng)絡(luò)分析;特色分析; (1)外部數(shù)據(jù)庫關(guān)聯(lián)分析(TCGA、ARCHS4); (2)關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)基因網(wǎng)絡(luò)圖分析; (3)時(shí)間序列分析; 5、標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析結(jié)果需上傳到可實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)循環(huán)挖掘的drtom云系統(tǒng)中,該系統(tǒng)需以下功能: (1)展現(xiàn)項(xiàng)目所有標(biāo)準(zhǔn)分析內(nèi)容; (2)圖表互動(dòng)快速分析; (3)具備個(gè)性化處理圖片功能等。 | 1.0 | 技術(shù)服務(wù) | 122500.00 | **** |
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項(xiàng)目查詢服務(wù)
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·幫您跟對(duì)合適的項(xiàng)目、找對(duì)準(zhǔn)確的負(fù)責(zé)人,全面掌握各項(xiàng)目的業(yè)主單位、設(shè)計(jì)院、總包單位、施工企業(yè)的項(xiàng)目經(jīng)理、項(xiàng)目負(fù)責(zé)人的詳細(xì)聯(lián)系方式
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·根據(jù)您的需要,向您指定的手機(jī)、電子郵箱及時(shí)反饋項(xiàng)目進(jìn)展情況
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